始基囊腫源於牙胚退化，直接取代牙齒發育，導致該位置牙齒完全缺失；其他囊腫多數包含已發育的牙齒結構或不影響牙齒形成。 **A. 含牙囊腫**：包含已萌出或未萌出的牙齒，囊腫包圍牙冠，牙齒仍存在於囊腫內，不會造成原位置缺牙。 **B. 始基囊腫**：起源於牙胚退化變性，直接替代整個牙齒發育過程，該位置完全無牙齒形成，造成真正的缺牙（missing tooth）。 **C. 牙泡囊腫**：實為含牙囊腫的同義詞，係牙囊退化形成，牙齒仍包含於囊腫內，不會造成原位置缺牙。 **D. 裂隙囊腫**：源於發育過程中上下頜骨之間的胚胎裂隙，與牙齒發育無直接關係，不會造成原位置牙齒缺失。