粒線體DNA的密碼系統具有獨特性，與核基因組存在重要差異，這是區別mtDNA的關鍵特徵。 **A. 正確** - 人類mtDNA長度約16,569 bp（16.5 kb），是已知最小的人類DNA分子。 **B. 正確** - mtDNA是環狀雙股DNA分子，缺乏組蛋白包裹，直接存在於粒線體基質中。 **C. 錯誤** - mtDNA的遺傳密碼與核基因組**不同**。mtDNA使用變異的密碼子：UGA編碼色胺酸（而非終止信號）、AGA/AGG為終止信號（而非精氨酸）、AUA編碼甲硫氨酸（而非異白胺酸），且某些密碼子的翼位配對規則也不同。 **D. 正確** - 粒線體擁有自身DNA和蛋白質合成系統，但其蛋白質成分約99%由核基因編碼，僅少量（13種蛋白質亞基）由mtDNA直接編碼，其餘由核基因轉譯後運入。